Заказник «Баджальский» расположен на северо-западном макросклоне Баджальского хребта - восточном отроге обширного Буреинского нагорья. Большую часть территории занимают первозданные величественные высокогорья и среднегорья. Как известно, «лучше гор могут быть только горы», и вершины Баджальского хребта неизменно манят к себе бывалых путешественников. И не может их испугать ни отсутствие «нормальных» дорог, ни труднопроходимые перевалы.
Здесь охраняются редкие и находящиеся под угрозой исчезновения млекопитающие, птицы, нерестилища дальневосточных лососей, а некая изолированность территории и особый микрорельеф привели к формированию в заказнике удивительного мира растений. Именно на высокогорьях Баджала в конце прошлого века было описано несколько новых для науки видов: одуванчик баджальский, астра Ворошилова, эдельвейс Благовещенского, зопничек Ворошилова, соссюрея Сочавы и т. д.
Несмотря на высокий природоохранный статус, территория заказника весьма уязвима. Основную экологическую угрозу несут браконьерство, незаконная вырубка лесов и лесные пожары ( чаще всего возникающие по вине человека). Природоохранная деятельность является первоочередной задачей Комсомольского заповедника.